Фамилия Селененкова образована от мужской формы Селененков, а та, в свою очередь, — от прозвища или мирского имени Селеня. Основа здесь — «селеный», то есть тёмный, смуглый, землистого цвета. В старых русских говорах «селеный» означало нечто, близкое к тёмно-зелёному или серому оттенку, иногда так называли человека с нездоровым цветом лица или просто очень загорелого. Вторая версия, менее вероятная, но тоже возможная: связь с диалектным «селить» (селиться, обживать землю), и тогда Селеня — это переселенец или человек, живущий на новом месте.

Суффикс -енк- в основе указывает на уменьшительно-ласкательную форму: Селеня — это, скорее всего, сын или младший родственник того, кого звали Селеным. А вот фамильный суффикс -ов (в женском роде -ова) — самый распространённый в центральной России. Он просто закрепил принадлежность: «чей?» — «Селененков», то есть потомок Селени. Фамилия не дворянская и не купеческая, а типично крестьянская или мещанская, появившаяся в XIX веке при массовом присвоении фамилий.

Географически фамилия Селененков (и её женская форма) привязана к южнорусским областям — Курской, Орловской, Воронежской губерниям. Именно там слово «селеный» в значении «тёмный, смуглый» было особенно употребительно. В современных базах данных носители фамилии чаще всего встречаются в Белгородской и Липецкой областях, что подтверждает её корни в чернозёмной полосе.

Интересная деталь: ударение в фамилии плавающее. В одних семьях говорят СелененкОва, в других — СеленЕнкова. Первый вариант ближе к исходному прозвищу (Селеня́), второй — к топонимическому или патронимическому прочтению (от Селене́нка). Оба имеют право на существование, и это не ошибка, а живой языковой процесс.