Фамилия Семенищена — яркий пример того, как украинская словообразовательная модель «накладывается» на русскую или общевосточнославянскую основу. Если сразу смотреть на суффикс, бросается в глаза окончание -а, которое в русском языке характерно для фамилий женского рода (типа Кузнецова, Иванова). Но в данном случае перед нами не женская форма от мужской фамилии Семенищен, а самостоятельная фамилия, образованная по украинской модели с суффиксом -енк(о), который в процессе адаптации на русской почве мог трансформироваться в -ен(а). Точнее, основа восходит к украинской фамилии Семенищенко, где -енк(о) — уменьшительно-патронимический суффикс. При переходе в русскую среду окончание -ко нередко заменяли на -а, чтобы фамилия звучала «по-русски» и склонялась как обычное существительное женского рода. Так Семенищенко превратилось в Семенищена.

Корень фамилии — Семен, от канонического имени Симеон (др.-евр. «услышанный Богом»). Это одно из самых распространённых крестильных имён на Руси, давшее огромное количество производных форм: Семён, Семка, Семейка, Сеня и так далее. В основе Семенищ- мы видим основу с суффиксом -ищ-, который в украинском языке часто указывал на принадлежность к роду (буквально «сын Семёна» или «потомок Семёна»). Получается, что Семенищенко — это «маленький Семён» или «сын человека по имени Семён». А фамилия Семенищена — это та же самая модель, только записанная в русской орфографической традиции.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским областям и востоку Украины. Встречается в Курской, Белгородской, Воронежской областях, а также в Ростовской и Краснодарском крае — то есть там, где исторически был силён украинский диалект и переселенческий поток. Носитель такой фамилии, скорее всего, происходил из крестьянской или казачьей среды: патронимические фамилии на -енко и их производные массово оформлялись у простого люда в XVII–XVIII веках, когда фамилии ещё не были закреплены за дворянством.

Важно не путать Семенищена с фамилией Семенищев. Последняя образована от прозвища Семенище (крупный, большой Семён) с помощью типичного русского суффикса принадлежности -ев. А Семенищена — это именно «украинский след» в русской фамильной системе, и её уникальность в том, что она сохранила форму, близкую к исходному украинскому варианту, но при этом полностью обрусела в написании.