Фамилия Сеньгова — женская форма, мужской вариант — Сеньгов. Она принадлежит к типичной для русского Севера модели: суффикс -ов (-ев) указывает на принадлежность «сын такого-то» или «из рода такого-то». Основа здесь — Сеньга. Что это за слово и откуда оно взялось, сразу не очевидно.

Самая вероятная версия ведёт к карельскому или вепсскому корню. В прибалтийско-финских языках «сенга» или «сенкя» означает «гриб». В карельских говорах «sien’gä» — это именно гриб, а в вепсском «seng» — то же самое. Прозвище Сеньга могли дать грибнику, торговцу грибами или даже человеку с приметной внешностью, напоминающей гриб (например, коренастому или с круглой шапкой волос). Такие прозвища по названиям растений, грибов и ягод были распространены в Заонежье и на юге Карелии, где русские крестьяне жили бок о бок с карелами и вепсами.

Менее убедительная версия — связь с русским диалектным «сеньга» в значении «мелкая монета» или «деньги» (от тюркского «теньга»). Но в северных говорах это слово почти не зафиксировано, а фамилия привязана именно к северо-западному региону — Архангельской, Вологодской губерниям и территории современной Карелии. Там же встречаются однокоренные фамилии Сеньгин, Сенькин, тоже от карельских прозвищ.

Сословно Сеньговы — почти наверняка государственные крестьяне или мещане. В дворянских родословных книгах фамилия не отмечена. Ударение, скорее всего, падает на первый слог: Се́ньгова, хотя в местных говорах могло смещаться. Носителей фамилии сегодня немного, и основная их часть живёт именно в Карелии и соседних областях — это дополнительный аргумент в пользу «грибной» версии.