Фамилия Сеняшин образована через суффикс -ин, который в русской ономастике указывает на принадлежность: «чей?» — сын Сеняши. Основа здесь — разговорная форма личного имени, а точнее, производное от канонического имени Семён.

Семён — русская форма древнееврейского имени Симеон, означающего «услышанный Богом». В народной среде это имя давало множество уменьшительных вариантов: Сеня, Сенюша, Сенята. От них, в свою очередь, образовывались патронимические фамилии. Сеняшин — один из таких вариантов, где исходным прозвищем или домашним именем могло быть Сеняша. Суффикс -ша в русских именах (как в Гриша, Федяша, Сеняша) характерен для ласкательно-фамильярного обращения, особенно в северных и центральных говорах.

Географически фамилия Сеняшин редкая и встречается преимущественно в Поволжье и на Урале. Это косвенно указывает на её позднее закрепление в крестьянской среде после отмены крепостного права, когда бывшие дворовые и государственные крестьяне массово получали фамилии по именам отцов. Сеняшины, скорее всего, происходят из среды, где имя Семён было распространённым, а его уменьшительная форма Сеняша закрепилась как семейное прозвище.

В отличие от более частых Сенявиных или Сенягиных, фамилия Сеняшин сохранила редкий суффиксальный вариант. Если Сенявин восходит к прозвищу Сенява (возможно, от диалектного «сенявить» — шуметь), то Сеняшин — чисто патронимическая форма, без дополнительного прозвищного значения. Это делает её «прозрачной» для этимолога: перед нами прямой потомок человека, которого в быту звали Сеняшей.