Фамилия Сенюшин — из числа тех, что произошли от уменьшительной формы личного имени. В её основе лежит имя Сенюша, которое, в свою очередь, является народной формой канонического имени Семён. Само имя Семён восходит к древнееврейскому Шимон и означает «услышанный Богом в молитве». Такие сокращённые и ласковые формы, как Сеня, Сенюша, Семушка, в старину были повсеместно распространены в крестьянской и посадской среде, поэтому неудивительно, что они дали жизнь целому кусту фамилий: Сенин, Сенюшкин, Семёнов, Сенюхин и, конечно, Сенюшин.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная. К основе Сенюш- добавили типичный русский суффикс принадлежности -ин, который указывает на родство: Сенюшин буквально означает «сын Сенюши», то есть потомок человека, которого в быту звали Сенюшей. Суффикс -ин в русских фамилиях встречается реже, чем -ов/-ев, и обычно крепится к основам, оканчивающимся на гласный или мягкий согласный, что делает форму Сенюшин естественной для имени Сенюша.

Интересно, что фамилия сохранила именно тот вариант имени, который сегодня почти вышел из употребления. Если формы Сеня и Сенька ещё встречаются, то Сенюша звучит архаично и сразу отсылает к деревенскому быту XVIII–XIX веков. Это даёт основание предположить, что предки носителей фамилии жили в среде, где придерживались традиционных имён и не гнались за столичной модой. Географически фамилия встречается в центральных и северных областях России, что косвенно подтверждает её исконно русское, а не украинское или белорусское происхождение, где скорее использовали бы формы Сенько или Сенюк.

В отличие от фамилий, образованных от прозвищ или ремесленных названий, Сенюшин не несёт никакой дополнительной смысловой нагрузки: он не указывает ни на занятие, ни на черту характера предка. Это чисто патронимическая фамилия, главная функция которой — закрепить за родом память о конкретном человеке, носившем имя Сенюша. Именно поэтому среди Сенюшиных нет и не может быть общего герба или единого родового промысла — их объединяет только имя дальнего предка, услышанное Богом, по библейской этимологии.

Стоит добавить, что в некоторых говорах Сенюшей могли называть не только Семёна, но и, реже, Серафима, однако эта версия менее правдоподобна. Основная масса случаев, зафиксированных в документах, связывает Сенюшу именно с Семёном, поэтому версия о происхождении от Семёна остаётся основной. Фамилия не является ни редкой, ни сверхчастотной, но её носители встречаются по всей России, что типично для патронимических фамилий, возникших в эпоху массового закрепления наследственных прозваний после отмены крепостного права.