Фамилия Сенюгин, согласно одной из версий, является вариантом фамилии Синюгин, которая образована от прозвища Синюга. Оно же, скорее всего, восходит к аналогичному существительному со значением «гриб сыроежка». Вполне вероятно, что основатель рода Сенюгиных был грибником. Чередование звуков и/е объясняется историческими изменениями в языке. Не исключено также, что фамилия Сенюгин ведет свое начало от имени Сенюга, производной формы крестильного мужского имени Семен (Симеон). Оно, в свою очередь, имеет древнееврейское происхождение и переводится как «услышанный Богом в молитве». В таком случае основатель рода Сенюгиных, возможно, был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Так и прозвище Синюга закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Сенюгин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Синюга, со временем получил фамилию Сенюгин.