Фамилия Сенюгина — женская форма фамилии Сенюгин. В основе лежит мужское личное имя Сенюга, которое в русской традиции было уменьшительно-ласкательной формой от крестильного имени Симеон (в бытовом произношении — Семён). Модель образования через суффикс -ин типична для северных и центральных областей России: она указывает на принадлежность «чей?» — сын или дочь Сенюги, то есть потомок человека с таким прозвищем или домашним именем.

Имя Семён (древнееврейское Шимон — «услышанный Богом») давало множество производных: Сеня, Сенюха, Сенюша, Сенюга. Форма Сенюга — с суффиксом -юг(а), который в русских говорах придавал имени оттенок фамильярности или даже некоторой грубоватости, как в словах «братюга», «дядюга». В документах XVI–XVII веков встречаются записи крестьян и посадских людей с именем Сенюга: например, в переписных книгах Новгородской земли фиксировали Сенюгу Микифорова. Это говорит о том, что фамилия могла сложиться в среде свободного сельского населения, а не только в дворянских родах.

Географически фамилия Сенюгина (и её мужской вариант) чаще всего встречается в Поволжье и на севере европейской части России — в Костромской, Вологодской, Кировской областях. В этих краях суффикс -ин держался дольше, чем на юге, где преобладали -ов/-ев. Если ваш предок носил фамилию Сенюгин, он с большой вероятностью был государственным или помещичьим крестьянином из центральной или северной России, а не из казачьих или малороссийских земель.

Споров о происхождении основы почти нет: версия с именем Семён — основная и бесспорная. Редкое исключение — возможная связь с диалектным словом «сенюга» (сенная кора, грубый корм), но эта гипотеза слаба, так как прозвища от названий кормов почти не встречаются. Ударение в фамилии обычно падает на второй слог — Сеню́гина, что подтверждает связь с полным именем Семён, а не с коротким Сеня.