Фамилия Сенякин образована от прозвища или нецерковного имени Сеняк, и в этом вопросе исследователи сходятся, а вот о происхождении самой основы спорят. Наиболее распространенная версия возводит Сеняка к уменьшительной форме имени Семен (церковная форма — Симеон), которое в переводе с греческого означает «слышащий Бога». Имя веками было одним из самых частых на Руси, поэтому и производных от него форм возникало множество: Сеня, Сенька, Сенюк, Сеняк. В этом ряду Сеняк выглядит вполне органично — так могли звать человека в кругу семьи или в деревне, а его дети и внуки уже получали фамилию Сенякины.

Существует и другая, менее очевидная гипотеза, которую стоит упомянуть, хотя она и уступает первой в правдоподобии. Согласно ей, прозвище Сеняк связано с нарицательным «сень» — тень, кров, приют, защита от зноя, или со словом «сени» — холодная прихожая у входа в избу. Тогда Сеняком могли прозвать человека, жившего в затененном месте, либо домоседа, который большую часть времени проводил в сенях, а не в горнице. Но эта версия держится на случайном звуковом совпадении: суффикс -як в русских прозвищах чаще указывает на отношение к имени или характерному признаку, а для обозначения «жителя сеней» скорее использовали бы другие словообразовательные модели. Поэтому связь с именем Семен выглядит убедительнее.

Сама фамилия построена по типичной для русских фамилий модели: к основе Сеняк добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Такой суффикс обычно присоединяли к основам на -а или -я, и он отвечал на вопрос «чей?»: Сенякин означает «сын Сеняка», «ребенок Сеняка». Это же словообразовательное гнездо дало фамилии Сенягин, Сенявин, Сенюхин, Сенькин — все они разошлись от разных уменьшительных форм того же Семена, хотя не всегда это очевидно без специального разбора.

В документах фамилия встречается преимущественно в центральных и южных регионах России, что косвенно подтверждает ее происхождение от имени, а не от диалектного слова: прозвищные фамилии от «сени» были бы более локальными, а Сенякины расселились широко. Точных дат появления фамилии в источниках назвать нельзя, но по модели образования она относится к позднему средневековью, когда фамилии массово закреплялись за крестьянством и посадскими людьми. Среди известных носителей фамилии нет громких исторических фигур, что типично для фамилий, возникших в простонародной среде, — это не умаляет их ценности как свидетельства живой народной традиции именования.