Фамилия Сергуняев образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Сергуняев послужило церковное имя Сергий. Сергуня - уменьшительно-ласкательная форма имени Сергей (в каноническом прочтении Сергий), которое образовано от латинского «сергиус» - «высокочтимый, высокий». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Сергуня, со временем получил фамилию Сергуняев. О точном месте и времени возникновения фамилии Сергуняев в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Сергуняев представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.