Фамилия Серин с большой вероятностью восходит не к мужскому, а к женскому имени. В основе лежит не «Серёжа» (как могло бы показаться на первый взгляд), а имя Серафима. Его сокращали до Сима, а в некоторых говорах — до Сера или Серя. От этого уменьшительного имени и образовали фамилию по простой модели: «Чей будешь?» — «Серин», то есть сын или потомок Серы (Серафимы). Суффикс -ин в русских фамилиях как раз и указывает на принадлежность: от матери — к детям.

Вторая версия, менее распространённая, но тоже возможная, — происхождение от прозвища Серый. Так могли назвать человека за невзрачную внешность, неброскую одежду или, наоборот, за скрытный, «неприметный» характер. В этом случае фамилия Серин — притяжательное прилагательное от прозвища Серый: «сын Серого».

Обратите внимание на географию: фамилия Серин встречается в центральных областях России, но заметно чаще — в южных и юго-западных регионах, в частности на Смоленщине и в Брянской области. Там в диалектах слово «сера» могло означать «серая глина» или «серый цвет», что даёт третью, сугубо региональную версию: прозвище могло быть связано с местным говором и обозначать человека, работавшего с глиной или жившего на серой земле.

Интересная деталь: в отличие от фамилий на -ов (Серов, Серов), фамилия на -ин (Серин) чаще указывает на основу, оканчивающуюся на -а или мягкий согласный. Поэтому, если мы принимаем версию от прозвища Серый, то исходная форма прозвища в родительном падеже звучала бы как «Серин» (сын Серого), что грамматически верно, но в живой речи закрепилась именно форма с -ин, а не с -ов. Это лишний раз подтверждает, что в сознании носителей фамилия ассоциировалась скорее с женским именем Серафима, чем с мужским прозвищем.

Таким образом, перед нами типичная «матримониальная» фамилия, образованная от имени матери. Предки первого Серина, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, и фамилию им дали по имени матери или бабушки Серафимы, которую в быту звали Серой.