Фамилия Сейтенова — женская форма фамилии Сейтенов, и её происхождение ведёт в тюркскую языковую среду, скорее всего, казахскую или ногайскую. Основа «Сейтен» восходит к арабскому имени «Сейит» (от араб. سيد — «господин», «повелитель») с тюркским притяжательным аффиксом -ен, который в данном контексте указывает на принадлежность: «Сейтен» буквально означает «принадлежащий Сейиту» или «из рода Сейитов». В исламской традиции «сейидами» называли потомков пророка Мухаммеда, поэтому имя Сейит и его производные (Сейтен, Сейт) были особенно почитаемы у тюркских народов, принявших ислам.

Словообразовательная модель проста: к основе «Сейтен» добавили русский патронимический суффикс -ов (в женском роде — -ова), что типично для фамилий, оформленных в Российской империи среди кочевых народов. Фамилия Сейтенова, таким образом, имеет смешанную природу: тюркское имя-основа и славянский фамильный формант. Это говорит о том, что предки носительницы фамилии, вероятно, были кочевниками-скотоводами или оседлыми земледельцами из казахских или ногайских родов, которые в XIX–XX веках получили фамилии по отчеству или по имени родоначальника.

Географически фамилия Сейтенова чаще всего встречается в Казахстане, особенно в западных и южных областях, а также среди казахской диаспоры в России (Астраханская, Оренбургская области). Встречается и у ногайцев, живущих на Северном Кавказе. Поскольку основа редкая и не имеет широко известных однокоренных аналогов (например, Сейтов или Сейтенов), можно предположить, что фамилия указывает на конкретный род или подрод, где имя Сейит было особенно популярно.

С точки зрения социального статуса, фамилия не несёт указания на дворянство или крестьянство — в тюркской среде она была распространена среди разных слоёв, от скотоводов до купцов. Единственное, что можно утверждать с уверенностью: предки носительницы фамилии были мусульманами, и их имя указывает на уважение к религиозной традиции.