Фамилия Шаболта звучит необычно для русского уха, и это подсказка: её корни почти наверняка не в великорусской среде, а в западнославянских или балтийских языках. Если отбросить суффиксы, которые могли появиться уже на русской почве, основа «шаболт-» не имеет очевидных параллелей в словарях древнерусских прозвищ или имён. Самая вероятная версия — что перед нами фонетический вариант польской или белорусской фамилии, образованной от слова «szabla» (сабля). В таком случае Шаболта — это прозвище воина, сабельника, либо человека, который их делал. Переход «szabla» в «шаболта» возможен при диалектном смягчении или через промежуточную форму «шабля» с добавлением экспрессивного суффикса «-ота» (как в «зевота» или «работа»), который придавал прозвищу оттенок действия или свойства.

Вторая, более редкая, но лингвистически допустимая гипотеза связывает фамилию с литовским «šabalas» — лохмотья, тряпка. В литовской антропонимии такие прозвища давали неопрятному или бедно одетому человеку. Учитывая, что фамилии на -та в русском языке встречаются в основном среди украинских и белорусских переселенцев (сравните: Шевченко, но Шаболта), версия о западнорусском или польско-литовском происхождении выглядит убедительнее, чем попытка вывести корень из чистого русского слова. В любом случае, фамилия не относится к числу древних боярских или дворянских — её носители, скорее всего, были ремесленниками, казаками или крестьянами из регионов современной Западной Украины, Беларуси или юго-восточной Польши.

У фамилии Шаболта нет распространённых вариантов с суффиксами -ов или -ин, что тоже характерно для прозвищного типа: она застыла в исходной форме, без патронимического оформления. Встречается она крайне редко, в основном на юге России и в восточных областях Украины, куда могла попасть с волнами переселения в XVIII–XIX веках. Если ваш предок носил эту фамилию, он, скорее всего, был человеком с яркой внешней чертой или профессией — военным ремесленником или, если верна вторая версия, обладателем не самой лестной характеристики, которая со временем потеряла свой первоначальный смысл.