Фамилия Шамекенов — редкий пример, где на стыке двух языков образовалась фамилия, звучащая по-русски, но собранная из тюркских корней. Её основа — личное имя Шамекен, которое в казахской и других тюркских ономастиках складывается из двух частей: «Шам» (от арабского «шам» — «свеча», «светильник», в переносном смысле «светоч», «сияние») и «екен» (тюркский аффикс со значением «являющийся», «сущий»). В итоге Шамекен можно перевести как «тот, кто есть свет», «сияющий». Имя неканоническое, народное, давалось с пожеланием ребёнку быть заметным, ярким человеком.

Русский суффикс -ов указывает на принадлежность: Шамекенов — «сын (или потомок) Шамекена». Такой способ оформления фамилий типичен для народов, вошедших в состав Российской империи, когда тюркские имена адаптировали под русскую патронимическую модель. В отличие от фамилий на -ин или -ский, здесь суффикс -ов прямо говорит о том, что предок носителя был известен под именем Шамекен, а не под прозвищем или названием ремесла.

Географически фамилия Шамекенов почти наверняка привязана к Казахстану и прилегающим тюркоязычным регионам. Встречается она редко, и это не случайно: имя Шамекен не входит в число самых популярных, а значит, фамилия могла возникнуть в одной локальной группе, возможно, в определённом роду или ауле. Сословно предки скорее всего были скотоводами или земледельцами — типичное занятие для кочевых и полукочевых тюркских общин, где фамилии закрепились поздно, в XIX — начале XX века, при переписях и паспортизации.

Стоит отметить, что в русском языке фамилия пишется строго через «е» — Шамекенов, а не «Шамикенов» или «Шамекенов». Вариант с «а» во втором слоге (Шамакенов) возможен, но маловероятен: тюркское «екен» устойчиво сохраняет «е» даже при русификации. Если встретится написание через «ё» — Шамекёнов — это ошибка переписчика, не отражающая ни произношения, ни этимологии.