Основой фамилии Шанина послужило мирское имя Шаня. Фамилия Шанина происходит от крестильного имени Алексей (в переводе с древнегреческого – “оберегающий”), либо же от Александр (“защитник”). Эти два имени имеют ряд одинаковых производных форм, начинающихся на Алекс. От одной из них могла быть образована фамилия Шанина. Согласно другой, менее правдоподобной версии, в основе этой фамилии лежит прозвище Шанява: так в новгородских говорах называли простака, разиню. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Шаня, со временем получил фамилию Шанина.