Фамилия Шаперева — женская форма, а мужская, Шаперев, встречается значительно реже. В основе фамилии, скорее всего, лежит прозвище или профессия, связанная с глаголом «шаперить». В южнорусских и украинских говорах это слово означало «ковылять», «идти вразвалку» или «делать что-то небрежно, кое-как». Человек с такой походкой или манерой работы легко получал прозвище Шапера, которое затем закрепилось за его потомками.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с польским «szapiera» (шапка, головной убор) или с профессией шапочника. Однако в русской ономастике фамилии на -ерев/-ерева часто носят отглагольный характер (сравните: Шамшерев — от «шамшить», болтать; Ковырев — от «ковырять»). Поэтому версия с «шаперить» как основой выглядит более органичной.

Суффикс -ев указывает на типичную модель образования русских фамилий от основ на мягкий согласный (Шапер-я → Шаперев). Географически фамилия тяготеет к югу России — её фиксируют в Воронежской, Ростовской областях и в Краснодарском крае. Это косвенно подтверждает диалектную природу корня: «шаперить» — слово южнорусское.

Встречается и вариант с двойным «п» — Шапперева, но это, вероятно, результат поздней орфографической путаницы или влияния немецкой фамилии Шаппер. Основной, исторически сложившийся вариант — с одной «п».

Таким образом, предок носителей фамилии Шаперев был, скорее всего, человеком с характерной походкой или неторопливым, «ковыляющим» стилем работы. Фамилия сохранила живую черту диалектной речи, которая сегодня почти утрачена.