Фамилия Шатаркова — редкий случай, когда географический корень почти наверняка перевешивает любые другие версии. Основа «шатар» отсылает к гидрониму Шатарка — реке в Смоленской области. Прозвища по названиям рек и озёр в русской ономастике встречаются, но обычно они ложатся в основу фамилий с суффиксом -ин (Шатаркин). Здесь же мы видим суффикс -ов, который чаще указывает на принадлежность к роду по отцу или на прозвище, образованное от прилагательного. Вероятнее всего, Шатарковым называли человека, жившего на реке Шатарке или переселившегося с её берегов. Женская форма Шатаркова — это либо дочь, либо жена такого человека.

Сам гидроним Шатарка имеет балтийское происхождение: литовское šatas — «плотина, запруда» или šatras — «пёстрый, рябой». В русских говорах слово «шатар» фиксировалось в значении «шатёр, навес», но это значение маловероятно для основы фамилии — прозвище Шатар (от «шатёр») дало бы скорее Шатаров, а не Шатарков. Таким образом, связь с рекой остаётся основной и самой обоснованной гипотезой.

Фамилия крайне редкая. По переписям и справочникам, её носители концентрируются именно в Смоленской области и прилегающих районах Беларуси, что подтверждает географическую привязку. В дореволюционных источниках Шатарковы могли быть крестьянами или мещанами, но сословную принадлежность точно установить сложно — фамилия не попала в губернские родословные книги дворянства. Единственное, что можно сказать с уверенностью: предки носителя фамилии жили на западе России, в зоне балтийского топонимического влияния, и их фамилия — буквальный отпечаток места на карте.