Фамилия Шайногин — один из тех случаев, где на первый взгляд ясная основа при ближайшем рассмотрении ставит перед исследователем вопрос: что именно легло в её корень? Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), а значит, в основе лежит прозвище или неканоническое имя Шайнога. Именно с этой основой и связана главная загадка.

Самая прямая и правдоподобная версия отсылает к диалектному слову «шайка» — в некоторых говорах так называли не только банду или деревянную посудину, но и нечто вроде «валюхи», «неуклюжего человека». Однако «шай» в корне может быть и вариантом «шайка» в значении «сойка» (птица) — тогда прозвище дали болтливому или крикливому человеку. Вторая часть — «нога» — в прозвищах нередко указывала на особенность походки, хромоту или просто длинные ноги. Таким образом, Шайнога мог быть человеком с «шайкой» (увечьем, шишкой?) на ноге, либо «сорочьей ногой» — то есть быстрым, вертлявым.

Менее вероятна, но не исключена версия о тюркском следе. В некоторых тюркских языках «шай» означает «достойный», «подходящий», а «нога» — «род», «племя». Но для русского прозвища такое сложное составное имя маловероятно: скорее всего, это случайное созвучие. К тому же, в русских говорах фиксируется и слово «шайкать» — «шуметь, галдеть», что тоже могло лечь в основу.

Фамилия редкая и, судя по географии, имеет локальное распространение. Её носители встречаются в основном в центральных и северных областях России, что подтверждает связь с севернорусскими говорами, где слово «шайка» в значении «увечье» или «нарост» было в ходу. Сословно, скорее всего, это крестьянская фамилия: прозвище давали в деревне, а при переписи записывали по отцу. Никаких дворянских родов с такой фамилией история не знает.

Если сравнивать с однокоренными — Шайкин, Шайков — то Шайногин стоит особняком: в нём не просто суффикс, а целое прозвище-предложение, что встречается реже и говорит о яркой, запоминающейся особенности первого носителя. Так что предок современных Шайногиных, скорее всего, был человеком с заметной внешней приметой — хромотой, необычной походкой или просто прозвищем, которое закрепилось на века.