Фамилия Шайнова — женская форма фамилии Шайнов, и её происхождение напрямую связано с мужским вариантом. Чтобы понять корни, нужно разобрать именно Шайнова.

В основе фамилии лежит прозвище или неканоническое имя Шай. Самая вероятная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках слово «шай» имеет несколько значений: «дар», «подарок», а в некоторых диалектах — «свет», «сияние». Прозвище Шай могли дать долгожданному, «дарованному» ребёнку или же человеку с заметной, «светлой» внешностью. Эта версия подкрепляется географией: фамилия Шайновы встречается в Поволжье и на Урале, в регионах, где веками жили татары, башкиры и другие тюркские народы.

Вторая, менее распространённая версия, связывает основу с глаголом «шаять» (устаревшее, диалектное — «полыхать», «гореть жарко»). В этом случае Шай — прозвище кузнеца или человека с горячим, вспыльчивым нравом. Однако эта гипотеза менее убедительна, так как фамилии с корнем «шай» в славянской среде редки, а тюркский след прослеживается чётче.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилий как из славянских, так и из заимствованных имён. Первоначально Шайнов — «сын Шая», то есть потомок человека по прозвищу Шай. Форма Шайнова закрепилась за женщинами как притяжательное прилагательное: «жена Шайнова» или «дочь Шайнова».

Встречается и вариант с ударением на первый слог — Ша́йнова, что характерно для некоторых волжских говоров. В целом, фамилия редкая, и её носители, скорее всего, имеют корни в смешанной русско-тюркской среде, где прозвища переходили в родовые имена без изменений.