Фамилия Щербаква — на первый взгляд редкий вариант, который чаще всего оказывается искажением или диалектной формой более распространённой фамилии Щербаков. Разница в одну букву — «в» вместо «в» в суффиксе — принципиально меняет словообразовательную модель, и это заслуживает отдельного разбора.

Основа фамилии — прозвище Щербак. В русских говорах «щербаком» называли человека со щербиной, то есть с недостатком зубов, с зазубриной на лице или с дефектом речи (шепелявого). Слово «щерба» (выбоина, зазубрина) дало целое гнездо фамилий: Щерба, Щербина, Щербаков, Щербатых. Щербак — тот же корень, но с суффиксом -ак, который в древнерусском языке часто указывал на носителя признака: «кто щербат».

Если бы фамилия оканчивалась на -ов (Щербаков), это была бы стандартная патронимическая модель: «сын Щербака». Окончание -ва в форме Щербаква — явление нетипичное для литературного русского языка. Скорее всего, перед нами либо описка при записи в метрической книге (писарь мог механически добавить «в» от соседней фамилии), либо результат адаптации фамилии в украинской или белорусской среде, где суффикс -ов иногда редуцируется. В украинском языке фамилия Щербак без суффикса — обычное дело, а добавление -ва могло возникнуть при русификации.

Географически фамилия Щербаква встречается крайне редко. В современных базах данных она единична и привязана в основном к южнорусским областям — Курской, Белгородской, Воронежской, где исторически смешивались русские и украинские говоры. В этих местах «щерба» и «щербак» были обиходными словами, а фамилии часто писали «на слух», без строгих орфографических норм.

Таким образом, носитель фамилии Щербаква может считать себя потомком человека, которого окрестили Щербаком — скорее всего, за заметную внешнюю примету (отсутствие зуба, шрам). Сама же форма фамилии — результат живого, не всегда грамотного бытования прозвища в крестьянской среде, где паспортная запись зависела от писаря. Это не ошибка, а исторический след: такие «неправильные» варианты ценны тем, что сохраняют подлинное звучание речи предков.