Фамилия Шелепунов образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. В основе прозвища Шелепун лежит нарицательное «шелеп» - «плеть, палка, хворостина». Скорее всего, Шелепуном называли того, кто не гнушался «шелепать» (то есть бить плёткой или палкой) других. Следовательно, прозвище могло указывать на особенности характера предка, например, на чрезмерную властность, жесткость человека. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шелепун, со временем получил фамилию Шелепунов. О точном месте и времени возникновения фамилии Шелепунов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Шелепунов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.