Фамилия Шелопугина образована от прозвища Шелопуга, которое восходит к аналогичному украинскому нарицательному, что в переводе на русский язык означает «недотепа». Вероятно, таким прозвищем нарекли неуклюжего, невнимательного, рассеянного человека. Таким образом, оно указывает на черты характера, которыми обладал предок Шелопугиных. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шелопуга, со временем получил фамилию Шелопугина.