Фамилия Шелюгов — пример редкой модели, где основа не от христианского имени, не от профессии, а от прозвища, связанного с внешностью или манерой поведения. В её основе лежит слово «шелюга» — так в русских говорах называли худого, длинного и нескладного человека, часто с намёком на нерасторопность или простоватость. В словаре Даля «шелюга» — это «долговязый, неуклюжий парень», а в некоторых регионах слово закрепилось за оборванцем или бродягой.

Суффикс -ов указывает на типичную для русских фамилий притяжательную форму: Шелюгов — буквально «сын Шелюги», то есть потомок человека с таким прозвищем. Фамилия образована по той же модели, что и Широков, Худяков, Молчанов — от прозвища, описывающего характерную черту. Однако, в отличие от них, «шелюга» — слово редкое, локальное, что делает фамилию географически привязанной. Скорее всего, её корни — в северных или северо-восточных говорах, где «шелюга» была в ходу, а не в центральных областях.

Менее вероятная, но допустимая версия связывает фамилию с диалектным «шелюг» — видом ивы или кустарника. В этом случае прозвище могли дать человеку, жившему в ивняке, или тому, кто занимался плетением из лозы. Но в пользу первого значения говорит то, что прозвища по внешности встречаются чаще, чем топографические.

Фамилия Шелюгов встречается нечасто, что подтверждает её узкорегиональное происхождение. Носители могли быть крестьянами или посадскими людьми, получившими фамилию при переписях по прозвищу предка. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это верный признак того, что перед нами фамилия из народной среды, а не из служилой аристократии.