Фамилия Шерстеникин предположительно восходит к названию села Шерстяники (или Шерстеники). Населённые пункты с таким названием могли существовать в России повсеместно, а потому не представляется возможным сказать, выходцем из какой именно местности был основатель рода Шерстеникиных. Название Шерстеники, очевидно, дано по названию основной профессии жителей этого села: они могли заниматься шерстобитной работой (взбиванием и разрыхлением шерсти перед прядением или валянием), производить шерстяные изделия и торговать ими. Менее вероятно, что в основе фамилии Шерстеникин непосредственно лежит прозвище Шерстеник, указывающее на профессию предка.