Фамилия Шишанок — редкий пример восточнославянской фамилии, образованной с помощью уменьшительно-ласкательного суффикса -ок от прозвища Шишан. Основа здесь — «шиш», одно из самых многозначных слов в русских говорах. В зависимости от региона «шишом» могли назвать острого на язык человека (от «шиш» — колючка, острый предмет), лазутчика или вора (в диалектах «шиш» — сыщик, соглядатай), а также мелкого беса или нечистую силу. В северных говорах «шиш» означал ещё и бродягу, нищего. Прозвище Шишан, таким образом, могло принадлежать человеку с ершистым характером, либо тому, кто промышлял не самым честным ремеслом, либо — в ироничном ключе — просто непоседливому парню.

Модель образования фамилии — патронимическая, но нестандартная. Обычно фамилии на -ок в Беларуси и на западе России (например, Ковалёк, Пинчук, Хомуток) указывали на сына или ученика. Шишанок — буквально «сын Шишана» (где Шишан — уже обладатель прозвища). Суффикс -ок здесь не просто уменьшительный, а указывает на происхождение, что типично для белорусской и западнорусской ономастики. Географически фамилия тяготеет к северо-западу России и востоку Беларуси — именно там прозвище «шиш» было распространено, а суффиксальная модель -ок сохранилась в крестьянской среде дольше, чем в центральных губерниях.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Шишов, Шишкин, Шишанов) показывает, что Шишанок — более поздняя, «домашняя» форма, не попавшая в дворянские родословные книги. Вероятно, предки носителя фамилии были крестьянами или мещанами, и фамилия закрепилась в устной форме без канцелярского переоформления на -ов. Встречаемость фамилии крайне низкая, что делает её маркером конкретного рода из определённой местности — скорее всего, из Псковской или Витебской губернии. Спорных версий здесь нет: корень «шиш» в значении «колючка» или «бес» — основной, и все остальные толкования (от названия растения или шишки) менее вероятны, так как в прозвищах чаще фигурирует человек, а не предмет.