Фамилия Шишицкая звучит так, будто её носительница родом из места с названием вроде Шишицы или Шишичи. Это типичная «географическая» фамилия, образованная по модели, распространённой в западных и южных регионах бывшей Речи Посполитой, а затем и Российской империи. Суффикс -ицк-/-ыцк- указывает на принадлежность к местности: Шишицкий — это тот, кто из Шишиц. Такая модель особенно характерна для польской, украинской и белорусской ономастики, где фамилии на -ский/-цкий часто давали дворянам, но со временем стали массовыми и у крестьян, и у мещан.

Основа фамилии — «шиш». В славянских языках у этого слова несколько значений: острый предмет, верхушка, шишка, а также воровской или разбойничий жаргон (шиш — бродяга, вор). В северных и сибирских говорах «шиш» называли лешего или нечистую силу. Однако наиболее вероятная версия — топонимическая. На карте Беларуси, Украины и Польши есть несколько небольших сёл и хуторов с корнем «Шиш»: например, Шишицы или Шишовцы. Фамилия могла закрепиться за человеком, который переехал из такого места и получил прозвание по прежнему месту жительства.

Менее распространённая, но возможная версия — происхождение от прозвища Шиш. Если предок не был переселенцем из деревни Шишицы, его могли прозвать за внешность (например, за острый, «шишкастый» нос или невысокий рост) или за характер — бойкий, колкий, неуживчивый. В этом случае фамилия образовалась бы по той же модели, но уже не от названия места, а от личного прозвища с добавлением суффикса -ицк-.

Форма Шишицкая — женская. Мужской вариант — Шишицкий. Встречаемость фамилии невысокая, что говорит о её локальном происхождении. Скорее всего, корни семьи — в западных губерниях России, на территории современной Беларуси или Украины. В дворянские родословные книги эта фамилия, судя по доступным данным, не входила, а значит, предки были, вероятнее всего, крестьянами или мещанами, получившими фамилию по названию деревни, в которой жили или откуда вышли.