Фамилия Шишнев образована от прозвища Шишень. По одной из версий, оно ведет свое начало от нарицательного «шиша», которое в пермских говорах имело значение «бедный люд». Вероятно, прозвище Шишень отражало социальное и материальное положение основателя фамилии (небогатый человек). В таком случае прозвище Шишень содержало указание либо на особенности места жительства предка (на возвышенности), либо на род его деятельности (крестьянин-земледелец или сенокосец). Соответственно, Шишнем могли прозвать медлительного, нерасторопного человека. Так и прозвище Шишень закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Шишнев. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шишень, со временем получил фамилию Шишнев.