Фамилия Шкенин — редкий случай, когда прозвище могло перейти в фамилию почти без изменений. В её основе лежит слово «шкень» или «шкеня». В русских говорах так называли щенка, но не просто собачьего детёныша, а в переносном смысле — неопытного, молодого человека, новичка в деле. Прозвище Шкеня давали либо самому младшему в семье, либо тому, кто выглядел моложе своих лет. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «Шкенин» значит «сын Шкени» или «из рода Шкени».

Интересно, что эта фамилия почти не встречается за пределами нескольких регионов. По данным современных телефонных справочников и баз адресов, основные очаги Шкениных — Архангельская область и северные районы Кировской области. Это наводит на мысль, что прозвище бытовало именно в северорусских говорах, где слово «шкеня» могло сохраниться дольше, чем в центральных диалектах.

Версия о связи с украинским или белорусским «шкена» (то же — щенок) менее вероятна: фамилия географически привязана к Русскому Северу. Искать в основе тюркские корни или связь с профессией смысла нет — слово чисто славянское, звукоподражательное, от того же корня, что и «скулить».

Словообразовательный тип у Шкенина простой: прозвищная основа плюс патронимический суффикс. Такие фамилии в старину нередко закреплялись за крестьянами и мещанами, поскольку в дворянской среде предпочитали модели на -ов/-ев или -ский. Носитель фамилии Шкенин, скорее всего, потомок человека, которого в деревне прозвали за молодость или неопытность — и прозвище прижилось настолько, что стало родовым именем.