Фамилия Шкербина — яркий пример того, как прозвище, данное по внешности или характеру, закрепилось в качестве родового имени. Её основа — слово «шкербина», которое в южнорусских и украинских говорах означает «щербина», «выбоина», «зазубрина», а применительно к человеку — «рябой», «со следами оспы на лице». Так могли прозвать человека с неровной, испорченной кожей, либо того, у кого недоставало зуба (от «щербатый»). Фонетический переход «щ» в «шк» — характерная черта для ряда говоров, где начальное «щ» произносится как «шк» или «шч».

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Шкербина — «сын или потомок Шкербы» (человека по прозвищу Шкерба). Это типичная модель для фамилий, образованных от прозвищ с конечным -а/-я: они склоняются как существительные женского рода и отвечают на вопрос «чей?». Аналогично возникли Щербина, Щербаков, но Шкербина сохранила именно диалектное звучание.

Географически фамилия тяготеет к югу России, к Курской, Белгородской, Воронежской областям, а также к востоку Украины. Встречается она относительно редко, что объясняется узкой диалектной зоной бытования исходного слова. В письменных источниках XVII–XVIII веков можно найти упоминания «шкербины» как прозвища, но массово фамилия закрепилась уже после отмены крепостного права, когда крестьянам массово присваивали фамилии по уличным прозвищам.

Споров о происхождении почти нет: версия с «щербиной» — основная и бесспорная. Альтернативные гипотезы, связывающие фамилию с тюркскими корнями (например, от «шкер» — «шакал»), лишены убедительных доказательств и не подтверждаются ни исторической фонетикой, ни ареалом распространения. Так что если ваш предок носил фамилию Шкербина, он, скорее всего, происходил из среды однодворцев или государственных крестьян южных губерний, а прозвище получил за внешнюю примету — рябину на лице или щербатый рот.