Фамилия Шмураткин — редкий случай, когда основа вызывает больше вопросов, чем суффикс. Модель образования прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Шмураткин — это сын или потомок человека по прозвищу или имени Шмуратка. Вопрос упирается в то, что такое «шмуратка» и откуда оно взялось.

Самая вероятная версия — фонетическое искажение или диалектное произношение слова «шмурка», которое в русских говорах, особенно южных и западных, означало «тряпка», «ветошка», «лохмотья». В переносном смысле Шмуркой могли прозвать неопрятного, неряшливого человека или, наоборот, бедняка, ходящего в обносках. Суффикс -ат- в основе Шмурат- мог появиться как экспрессивное расширение: Шмуратка — это «тот ещё шмурка», с оттенком пренебрежения или шутки. Такая модель (корень + -ат(к)а) встречается в прозвищах, подчёркивающих характерный признак (ср. Лохматка, Грязнятка).

Вторая версия, менее убедительная, связывает фамилию с украинским или белорусским «шмурат» — «обрывок», «клочок». В этом случае значение близко к первому варианту, но география могла быть иной: фамилия Шмураткин встречается преимущественно в центральных и южных областях России, а также в Беларуси, что указывает на западнорусские или малороссийские корни.

Третья, спорная гипотеза — связь с еврейским именем Шмуэль (Самуил) через уменьшительную форму Шмура. Однако для фамилии Шмураткин это маловероятно: типично еврейские фамилии на -ин (Шмулькин, Шмуйлович) строятся от других основ, а суффикс -ат- в данном контексте нетипичен для ашкеназской ономастики. Скорее всего, перед нами чисто славянское прозвище, закрепившееся в крестьянской среде.

Таким образом, предок носителя фамилии Шмураткин, по всей видимости, получил прозвище Шмуратка за внешний вид или бедность. Фамилия недворянская, нечастотная, но её основа — живое диалектное слово, которое сегодня почти забыто.