Фамилия Шмуратова — женская форма, а её мужской вариант Шмуратов, скорее всего, имеет прозвищное происхождение. В основе лежит слово «шмура» или «шмурый». В русских говорах, особенно уральских и сибирских, «шмурый» — это хмурый, угрюмый, пасмурный человек, а также, в некоторых диалектах, — неряха, неопрятный. То есть прозвище Шмура давали либо по характеру (нелюдимый, молчаливый), либо по внешнему виду.

Версия с тюркскими корнями маловероятна, хотя фамилия встречается в Поволжье и на Урале, где были контакты с тюркскими народами. Близкое по звучанию татарское «шмур» не имеет устойчивого значения, а слово «шмура» как заимствование из тюркских языков не фиксируется. Поэтому славянская основа — основная.

Суффикс -ов- указывает на типичную русскую модель образования: Шмура → Шмуратов — сын Шмуры. Это отчество второго порядка, которое закрепилось как фамилия. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Шмура́тов, хотя в бытовой речи встречаются варианты.

Встречаемость фамилии невысокая, она редкая. Наибольшая концентрация носителей — в Челябинской, Курганской областях и в Башкортостане. Это объяснимо: именно в этих регионах в XIX веке активно фиксировались крестьянские фамилии, образованные от диалектных прозвищ. Предки современных Шмуратовых были, вероятно, государственными или заводскими крестьянами на Урале, и фамилия закрепилась за одной ветвью рода, не получив широкого распространения.

Сравните с однокоренными: Шмурыгин, Шмурнов, Шмурло. У них та же основа, но разные суффиксы, что говорит о параллельном, независимом возникновении в разных местностях. Шмуратов — один из вариантов, сохранивший архаичную, почти забытую сегодня диалектную черту.