Фамилия Шобоева — женская форма фамилии Шобоев. Чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с мужским вариантом. Основа здесь — «Шобой», и это не имя, а скорее всего прозвище. В русской ономастике фамилии на -ев/-ов часто образовывались от прозвищ, и Шобоев не исключение.

Корень «шоб-» может отсылать к диалектному слову «шобой» или «шобонь». В некоторых говорах, особенно на севере и в Сибири, так называли неряшливого, растрёпанного человека, небрежно одетого. Есть и другая версия, более редкая: в тюркских языках встречаются корни со значением «сбивать, толкать», но для фамилии Шобоев это маловероятно — география её бытования указывает на русский Север, в частности на Архангельскую и Вологодскую области. Там диалектное слово «шобой» (или «шобонить» — тормошить, теребить) вполне могло дать прозвище человеку с взлохмаченными волосами или неопрятным внешним видом.

Модель образования проста: к прозвищу Шобой добавили типичный русский патронимический суффикс -ев (после мягкого согласного «й»), что дало фамилию Шобоев. В дореволюционной России такие фамилии чаще всего встречались у крестьян и мещан, а не у дворян. Сословная принадлежность носителей, скорее всего, была самой обычной: предки — землепашцы или ремесленники из северных губерний.

Среди однокоренных фамилий — Шобонов, Шобонин, Шоболов. Все они образованы от того же диалектного корня, но с разными суффиксами. Фамилия Шобоева не принадлежит к числу распространённых, но встречается стабильно в тех же регионах, что и мужской вариант. Значение её, при всей прозрачности, не стоит воспринимать как обидное: в среде, где давали прозвища, это был бытовой ярлык, а не оскорбление.