Фамилия Шоканаев — один из тех случаев, когда суффикс -ев указывает не на русского, а на тюркского предка. Она образована по стандартной для русской ономастики модели: к основе Шокан- добавили -ев, получив значение «сын Шокана» или «потомок Шокана». Но само имя Шокан — это не русское, а казахское или, шире, тюркское имя. В языках тюркской группы «шокан» может означать «крепкий», «могучий», иногда трактуется как вариант имени Чокан (известного казахского ученого Чокана Валиханова). Таким образом, фамилия Шоканаев — это русифицированная форма отчества от тюркского личного имени.

Географически фамилия тяготеет к Казахстану и прилегающим регионам России (Оренбургская, Астраханская области). Встречается она редко — это не массовая фамилия, а скорее родовая, сохранившаяся в нескольких семейных ветвях. По сословному происхождению предки могли быть как кочевниками-скотоводами, так и оседлыми крестьянами или казаками, принявшими фамилию при переходе в русское подданство или при записи в метрические книги. Суффикс -ев (а не -ов) здесь не случаен: в тюркских именах, оканчивающихся на мягкий согласный или на -н, при адаптации чаще появляется именно -ев.

Спорных версий здесь немного, и они не слишком убедительны. Иногда фамилию пытаются связать с тюркским «шок» (удар, толчок) — мол, прозвище бойкого человека. Но это натяжка: имя Шокан в источниках встречается именно как личное, а не прозвищное. Поэтому основная и самая правдоподобная версия — патроним от имени Шокан, которое носил первый известный носитель в роду.

Если вы носите фамилию Шоканаев, ваши предки с большой вероятностью жили в казахской степи или на границе с ней, а сама фамилия — напоминание о человеке, которого звали Шокан, что бы это имя ни значило в его время.