Фамилия Шоканов — типичный пример русской фамилии, образованной от тюркского имени или прозвища. В её основе лежит имя Шокан (варианты — Шукан, Шоканбай), которое было распространено у казахов, татар, башкир и других тюркских народов. Скорее всего, предок носителя этой фамилии был крещёным татарином или выходцем из тюркской среды, перешедшим в православие, — иначе фамилия осталась бы в исходной форме без русского суффикса.

Значение имени Шокан неоднозначно. По одной версии, оно восходит к тюркскому слову «шок» — «удар», «толчок», то есть прозвище могло означать «бойкий», «резкий», «напористый». По другой версии, это уменьшительная форма от более длинного имени, например, Шоканбай, где вторая часть означает «богатый». В казахской ономастике имя Шокан известно благодаря Шокану Уалиханову — знаменитому учёному и путешественнику XIX века, но его фамилия осталась без русского окончания.

Суффикс -ов указывает на стандартную модель русских фамилий, закрепившуюся в XVIII–XIX веках. Такую фамилию получали дети или внуки человека по имени Шокан: «чей?» — Шоканов, то есть «сын Шокана». Географически фамилия встречается в Оренбургской, Челябинской областях, в Башкортостане и Татарстане, а также в северных районах Казахстана — там, где исторически шло смешение русского и тюркского населения.

Интересная деталь: в дореволюционных метрических книгах фамилию могли записывать двояко — Шоканов и Шукинов, в зависимости от местного произношения имени. Это связано с тем, что в тюркских языках гласные звуки «о» и «у» в первом слоге часто чередуются. Поэтому при поиске предков стоит учитывать оба варианта написания.