Фамилия Штанина образована от прозвища Штаня, которое восходит к нарицательному «штаны» со значением «одежда, имеющая две короткие или длинные штанины и закрывающая ноги и нижнюю часть туловища». Однако ранее нарицательное «штаны» («штоны») употреблялось в значении «мужское исподнее платье, обтяжные или короткие, по икры брюки, кои носились при чулках и башмаках», «подштанники». Предположительно, слово «штаны» заимствовано из тюркского и восходит к слову ičton «подштанники», которое в свою очередь восходит к двум тюркским основам: ič «внутренний, исподний» и tоn «одежда, шуба». Возможно, прозвище Штаня содержит указание на род деятельности человека: так называли мастера по пошиву брюк и мужского белья. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Штаня, со временем получил фамилию Штанина.