Фамилия Шупенков образована от прозвища Шуп. Скорее всего, прозвище Шуп связано с малороссийским глаголом «шупить», то есть «знать, ведать, понимать». Следовательно, Шупом могли прозвать знахаря, колдуна, ведуна, чародея, волхва. Согласно другой гипотезе, в основе этой фамилии лежит диалектное слово «шуп»: так в тверских говорах называли первый осенний плавучий лед. Вероятно, прозвище Шуп мог так же получить и ребенок, родившийся во время паводка.