Фамилия Шупина, скорее всего, образована от прозвища или мирского имени Шупа. В русской ономастике это слово имеет несколько возможных толкований, и выбор между ними зависит от регионального контекста и того, насколько далеко мы готовы заглянуть в диалектную лексику.

Самое прямое объяснение лежит на поверхности: в южнорусских и украинских говорах «шупа» — это щуп, тонкий металлический или деревянный стержень для проверки сыпучих тел (зерна, муки) или для зондирования почвы. Прозвище Шупа могли дать либо человеку высокому и худому («длинный, как щуп»), либо тому, чья работа была связана с таким инструментом — например, амбарному сторожу, мельнику или землемеру. Однако есть и менее очевидная версия: в некоторых диалектах «шупать» означает «шуметь, возиться, шарить». Тогда Шупой называли беспокойного, суетливого или неаккуратного человека, который всё время что-то ищет и перекладывает.

Фамилия стоит в женской форме (Шупина), но её мужской вариант — Шупин. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Шупин, то есть сын Шупы. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а/-я. Географически фамилия встречается не повсеместно, а тяготеет к регионам, где исторически сильны южнорусские говоры: Курская, Белгородская, Воронежская области, а также Украина. Встречается она и в Сибири, куда переселенцы принесли её в XVII-XVIII веках.

Стоит отметить, что в русских говорах существует однокоренное слово «шупак» (щука), и некоторые исследователи допускают связь фамилии с рыбацким прозвищем. Но это менее вероятно: суффикс -ин в фамилии Шупин чётко указывает на основу на -а, а не на -ак. Если бы фамилия была от «шупак», она звучала бы как Шупаков. Так что вариант с «щупом» или «шалуном» выглядит убедительнее. В целом, фамилия Шупина — редкий пример, когда прозвище, лёгшее в её основу, не утратило связи с живым диалектным словом, и его значение можно восстановить почти напрямую.