Фамилию Шустовских стоит начать разбирать с конца: суффикс -их/-ых в русской ономастике — один из самых красноречивых. Он указывает на северные и северо-восточные регионы России, прежде всего на Архангельскую, Вологодскую, Вятскую губернии и Сибирь. Такие фамилии (Коротких, Седых, Шустовских) закрепились в XVI–XVII веках как обозначение целого рода: «из дома Шустовых», то есть «Шустовские» — это «те, кто из семьи Шустовых». Форма на -ских — вариант, характерный для тех же территорий, где окончание -ых со временем могли заменять на -ских под влиянием книжного языка или канцелярской записи.

Основа фамилии — Шуст. В русских говорах «шуст» означало не только «быстрый, проворный», но и имело конкретное прозвищное значение. По словарю В. И. Даля, «шуст» — это «бойкий, расторопный человек», а в некоторых диалектах — «плут, пройдоха». Прозвище Шуст давали человеку с живым характером, тому, кто всё делал сноровисто и быстро. Встречается и другая версия: в северных говорах «шуст» — это «печной вьюшек, заслонка», но маловероятно, что прозвище дали по предмету домашнего обихода, скорее по черте поведения.

Модель образования типична: прозвище Шуст → фамилия Шустов (чей? — сын Шуста) → отчество или родовое имя Шустовский → фамилия Шустовских (из рода Шустовских). То есть носитель фамилии — прямой потомок человека по прозвищу Шуст, жившего, вероятно, в XVI–XVII веках где-то на Русском Севере или в Приуралье. Социальный состав предков мог быть разным: и крестьяне, и посадские люди, и казаки — суффикс -их/-ых не был привилегией знати, а наоборот, чаще встречался у непривилегированных сословий.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Шустов, Шустовский, Шустиков) показывает, что Шустовских — самая редкая и территориально привязанная форма. Если Шустовы встречаются повсеместно, то Шустовских — маркер конкретного региона, и по ней можно с высокой вероятностью определить, что предки жили, например, в бывшей Вятской губернии или в Пермском крае. Фамилия не документирована в старых боярских списках, что подтверждает её народное, «низовое» происхождение.