Фамилия Швагирева — женская форма, мужская — Швагирев. В центре внимания здесь не столько корень, сколько редкость модели: фамилия образована с помощью суффикса -ев, который в русской ономастике обычно присоединяли к основам на мягкий согласный или на -й. Однако в данном случае основа заканчивается на твёрдый «р», что для фамилий на -ев нехарактерно. Чаще встречается вариант Швагиров, но закрепилось именно Швагирев, и это может говорить о диалектном произношении основы или о том, что фамилию фиксировали в местности, где твёрдый согласный смягчался.

Корень «шваг-» — тёмный. Наиболее вероятная версия связывает его с диалектным словом «швага»: в некоторых русских говорах так называли тонкую жердь, хворостину или слабого, худого человека. В этом случае прозвище Швага дали либо долговязому и хилому, либо тому, кто работал с таким материалом, например плёл изгороди. Менее убедительно возведение к украинскому «швага» — «плеть, кнут»; для великорусской фамилии это маловероятно.

Словообразовательный тип — типично «прозвищный»: имя Швага + патронимический суффикс -ев. Фамилия могла появиться в северных или центральных губерниях, где фиксировались подобные прозвища. В документах XVII–XVIII веков встречаются крестьяне и посадские с фамилией Швагин (от той же основы), а Швагиревы — более редкий вариант, возможно, с дополнительным суффиксом -ир- (как в фамилиях Шипирёв, Ковырев), который вносил оттенок принадлежности или профессии.

Сословно фамилия, скорее всего, крестьянская или однодворческая. Дворянских родов Швагиревых в Российской империи не зафиксировано. Географически фамилия встречается в Вологодской, Кировской и Ярославской областях, а также в Поволжье — что подтверждает её севернорусское происхождение.