Фамилия Шышков является самобытным памятником славянской культуры. Фамилия Шышков образована от прозвища Шишко. Появление гласной «ы», предположительно, объясняется ошибкой при регистрации фамилии. По одной из версий, прозвище Шишко ведет свое начало от нарицательного «шишка» в значении «важное, влиятельное лицо, вельможа». Кроме того, шишкой в старину называли «передового бурлака при тяге судов бечевой». В таком случае прозвище Шишко, скорее всего, относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности предка (бурлак). Кроме того, возможно, что Шишко прозвали человека, который занимался собиранием шишек. Как известно, шишки некоторых растений используются в лекарственных целях, поэтому предок Шышковых мог быть и лекарем. Согласно еще одной гипотезе, в основе фамилии Шышков лежит не прозвище, а мирское имя Шишко, восходящее к слову «шишка» в значении «нарост на теле». В данном случае, надеясь иметь красивого и здорового мальчика, родители назвали его Шишко. Веселовского записаны родственные именования: Шишка Васильевич Чертовский, новгородский помещик (XVI в.), а также Иван Федорович Шишкин Ольгов (XVI в.). Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шышко, со временем получил фамилию Шышков. Безусловно, фамилия Шышков представляет собой замечательный памятник славянской культуры. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Шышков можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований.