Фамилия Сидохин образована от имени Сидоха — уменьшительной формы крестильного имени Сидор (в церковной форме Исидор). Это имя греческого происхождения, означающее «дар Исиды»; в русской народной среде оно было распространено и дало множество производных форм: Сидорка, Сидоша, Сидоха, Сидох. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Сидохин значит «сын Сидохи» или «человек из рода Сидохи».

В отличие от более частых Сидоровых и Сидоркиных, фамилия Сидохин встречается реже, что говорит о локальном бытовании исходного прозвища. Вероятнее всего, она закрепилась в южнорусских или среднерусских говорах, где усечённые формы имён на -оха (Сидоха, Мироха, Антоха) были особенно употребительны. По этой же модели образованы фамилии Сидохин и Сидохин — с разницей в суффиксе, но с общей основой.

В некоторых случаях нельзя исключать, что в основе лежит не имя, а прозвище Сидоха, данное за манеру сидеть (от глагола «сидеть»). Однако эта версия менее вероятна: ономастическая традиция устойчиво связывает фамилии на -охин с производными от канонических имён, а не от бытовых прозвищ. Имя Сидор в прошлом было настолько популярно, что его дериваты перекрывают альтернативные объяснения.

Социально фамилия Сидохин — типично крестьянская или мещанская, без признаков дворянского происхождения. В документах XVI–XVII веков она не фиксируется, что указывает на её позднее оформление, скорее всего, в XVIII–XIX веках, когда фамилии массово закреплялись за податными сословиями. Географически её носители встречаются в Воронежской, Курской и Ростовской областях, что подтверждает южнорусский след.

Сравнение с однокоренными фамилиями: Сидохин стоит в одном ряду с Сидоровым, Сидоркиным, Сидошиным, но отличается редким суффиксом -ох- (вместо более типичного -ор- или -к-). Это делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если в роду есть Сидохины, можно сузить ареал предков до территории, где бытовала форма Сидоха.