Фамилия Сидохина образована от мужского имени Сидоха — разговорной формы канонического имени Сидор. В свою очередь, Сидор — это народная переделка греческого Исидор, что значит «дар Исиды» (египетской богини). В русской ономастике такие «усечённые» формы — Сидоха, Сидоша, Сидоря — были распространены в крестьянской и посадской среде: имя сокращали, добавляя суффикс субъективной оценки, и оно становилось основой для фамилии.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Сидохина — дочь или жена Сидохи. В русской традиции фамилии на -ин чаще всего образовывали от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а/-я. Так, Сидохин сын со временем превратился в Сидохина, а форма на -а закрепилась за женщиной или как вариант фамилии в женском роде.

Географически фамилия Сидохина встречается в центральных и южных регионах России — в Воронежской, Тамбовской, Ростовской областях. Это характерно для фамилий, которые не ушли далеко от места своего возникновения: Сидор и его производные были особенно популярны среди крестьян Черноземья, где имя Сидор в XVI–XVII веках входило в десятку самых употребительных.

Спорных версий у фамилии практически нет. Иногда её ошибочно связывают с диалектным глаголом «сидохать» (сидеть, медлить), но это маловероятно: подавляющее большинство фамилий на -охин/-охина имеют именную, а не глагольную основу. К тому же в документах XVII–XVIII веков фиксируются именно патронимы от Сидоха, а не от прозвища.

Таким образом, предки современных Сидохиных — это люди, носившие бытовое имя Сидоха, то есть, скорее всего, крестьяне или ремесленники, чья фамилия закрепилась через отчество.