Фамилия Сигаенко — характерный пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -енко. Этот суффикс в украинской ономастике XVI–XVIII веков выполнял функцию отчества или указания на принадлежность к роду: Сигаенко буквально означало «сын Сигая» или «потомок Сигая». В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые закрепились в основном за дворянством и духовенством, фамилии на -енко в массе своей принадлежали казакам, крестьянам и мещанам Левобережной и Слободской Украины.

Основа фамилии — прозвище Сигай. Его происхождение прозрачно и связано с глаголом «сигать» — прыгать, скакать, быстро перемещаться. В говорах «сигай» могло означать непоседливого, верткого человека, того, кто легко перепрыгивает препятствия или суетится. Встречается и другая версия: в некоторых диалектах «сигать» значило «бросать, кидать» — тогда прозвище мог получить метатель или забияка. Семантически это близко к фамилиям Скачко, Прыгун, но с более выраженным украинским колоритом.

Стоит обратить внимание, что фамилия Сигаенко не имеет отношения к еврейским фамилиям на -енко, которые иногда возникали от ивритских имен. В данном случае корень чисто славянский, и никаких заимствований из идиша или иврита здесь нет. Встречаются однокоренные фамилии Сигай, Сигайло, Сигаев — последняя уже русифицированная форма, характерная для тех, кто переселился в великорусские губернии, где суффикс -енко заменяли на -ов.

Географически фамилия Сигаенко чаще всего фиксируется в Полтавской, Черниговской и Киевской областях, а также в Краснодарском крае, куда в XIX — начале XX века переселялись украинские крестьяне. В официальных документах встречаются варианты написания Сигаенко, реже — Сигаенко с ударением на второй слог, но нормативным считается ударение на последний слог, как у большинства фамилий на -енко. Носители фамилии — потомки казаков или крестьян, чей предок получил прозвище за подвижность, резвость или, возможно, за характерный жест.