Фамилия Синягин образована от прозвища Синяга, и у этого прозвища есть как минимум две равноправные версии происхождения. Первая отсылает к нарицательному «синяга» — так в XIX веке называли синюю ассигнацию. Если следовать этой логике, прозвище могло закрепиться за человеком состоятельным, при деньгах, либо за тем, кто любил ими сорить. Вторая версия — прозвищная, по внешнему виду: синягой могли назвать бледного, синюшного человека, возможно, нездорового. Обе трактовки имеют право на жизнь, и без дополнительных генеалогических данных выбрать главную сложно.

Суффикс -ин в фамилии указывает на притяжательную модель: Синягин — это «сын Синяги», «из рода Синяги». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или личных имён, оканчивающихся на -а/-я. Родственные фамилии — Синяков, Синяев, Синягин — все они восходят к тому же корню, но с разными суффиксами, что говорит о независимом возникновении в разных ветвях.

Первые письменные следы фамилии уходят в XVII век. В «Истории России с древнейших времен» С.М. Соловьева, в главе о царствовании Алексея Михайловича, упоминается рейтарский майор Синягин. Это одно из ранних свидетельств бытования фамилии в служилой среде. К более позднему периоду относятся сведения о голове московских стрельцов Матвее Тимофеевиче Синягине — фигуре заметной, судя по должности.

Однако самая яркая и документально насыщенная история — у смоленской ветви Синягиных. Их родоначальником считается Акакий Синягин, государственный крестьянин. Примечательная деталь: он оставил после себя двадцать три ребёнка, но до зрелого возраста дожили только восемь. Такая плодовитость сама по себе говорит о крепкой крестьянской семье, но главное — о статусе. Синягины были не крепостными, а государственными крестьянами, а значит, имели право заниматься коммерцией, платить оброк и распоряжаться своим временем.

Этой возможностью они воспользовались сполна. Семья занялась извозом: гоняла обозы с северными товарами — льном, пенькой — на юг России, а обратно везла сухофрукты и соленую рыбу. Торговля пошла в гору, и к концу XIX века Синягины, по свидетельствам, контролировали значительную часть смоленской торговли, а некоторые члены семьи выбились в крупные хлеботорговцы. Так потомки человека с прозвищем Синяга, возможно, бледного или, наоборот, денежного, превратились в купеческую династию, где прозвище предка стало родовым знаменем.