Фамилия Сипатин восходит к прозвищу Сипата. Скорее всего, оно ведет свое начало от глагола «сипать» — «дергать», «тянуть с перемежкою». Это слово, как правило, встречается в речи западных славян. Однако установить точно, каким именно видом трудовой деятельности занимался основатель данного рода, не представляется возможным, поскольку в старину большая часть работ была связана с передвижением, перемещением чего-либо. Согласно другой версии, прозвище Сипата образовано от глагола «сипеть». Скорее всего, такое прозвище получал человек с сиплым, хриплым голосом. Однако нельзя исключать и связь этого прозвища с диалектными словами «сип, сипа, сипач» — так называли грубого, необразованного мужика. Прозвище Сипата и образовавшаяся от него фамилия зафиксированы в исторических документах XVI-XVII вв.: Бодеин Сипатин, начало XV в., Торжок; Иван Сипата, боярин, 1552г. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Сипата, со временем получил фамилию Сипатин.