Фамилия Скарятина — женская форма от Скарятин, и её происхождение ставит перед исследователями загадку, которую не решить одним словарём. Основа фамилии — «Скарят(а)» или «Скорят(а)» (в старых записях встречаются оба варианта), а суффикс -ин указывает на принадлежность: Скарятин — «сын Скаряты». Само же прозвище Скарята, скорее всего, связано с диалектным словом «скара» или «скора» — так в северных и центральных говорах называли шкуру, кожу, мех. В древнерусском языке «скора» означала именно шкуру животного, отсюда и «скорняк» — мастер по выделке кож. Таким образом, прозвище Скарята мог получить либо скорняк, либо человек, торговавший мехами, либо тот, кто носил характерную одежду из кожи или меха.

Менее вероятная, но возможная версия выводит фамилию от личного имени Скарята как производного от Скара — краткой формы крестильного имени, например, Скарапион (от греческого «скорпион»). Однако такая гипотеза слаба: имя Скарапион было крайне редким в русской традиции, а связь со шкурой и мехом — куда более естественна для бытового прозвища.

В исторических документах фамилия Скарятины известна с XVI века и связана с дворянским родом, ведущим происхождение от выехавшего из Золотой Орды мурзы. Эта родословная легенда, типичная для русского дворянства, не отменяет народного корня фамилии: прозвище Скарята могло существовать задолго до официального закрепления за родом, а затем стать родовым именем. Географически фамилия привязана к центральным и северным областям России — именно там слово «скора» было в ходу.

Ударение в фамилии Скарятина — на второй слог: Скаря́тина. Встречается вариант Ска́рятина, но он считается просторечным и менее правильным с точки зрения исторической нормы.