Фамилия Скирдина — это женская форма, а её мужской вариант — Скирдин. В разговоре о происхождении обычно имеют в виду общую основу для обоих вариантов.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность. В русской традиции такие фамилии часто образовывались от прозвищ или профессий отца. Основа «Скирд-» прямо отсылает к слову «скирда» — большой продолговатый стог сена или соломы, уложенный особым образом для хранения под открытым небом.

Вероятнее всего, прозвище Скирда дали человеку, который занимался укладкой скирд. Это было ответственное и требовавшее сноровки крестьянское занятие: неправильно сложенная скирда могла промокнуть или загореться от самовозгорания. Мастера-скирдоправы ценились в сельской общине. Второй, менее вероятный вариант — прозвище могли дать по внешнему сходству: высокому, плотному или неуклюжему человеку, напоминающему стог. Однако первая версия (по роду занятий) выглядит убедительнее, так как фамилии от названий профессий — один из самых распространённых типов в русской ономастике.

Фамилия Скирдин (и Скирдина) фиксируется в разных регионах России, но чаще всего встречается в областях с развитым сенокосным хозяйством — в центральной России, Поволжье и на Урале. Встречаются и родственные фамилии: Скирдов, Скирдовой, а также Скирдонов — от той же основы, но с другим суффиксом.

Таким образом, предки современных Скирдиных с большой долей вероятности были крестьянами, специализировавшимися на заготовке сена. Фамилия эта недворянская, а народная, что не делает её менее интересной для истории семьи.