Фамилия Скирдин — один из тех случаев, когда прозвище предка напрямую связано с его занятием или местом в хозяйстве. В основе лежит диалектное слово «скирда» — большая продолговатая кладь сена или соломы. В южных и центральных губерниях России так называли не просто стог, а уложенный особым способом сноп, который ставили на поле для просушки. Человек, получивший прозвище Скирда, скорее всего, либо занимался укладкой скирд (скирдовальщик), либо владел большим количеством сена, либо сам был крупным, плотным — по аналогии с формой скирды.

Модель образования фамилии проста и прозрачна: к основе «Скирд-» добавили патронимический суффикс «-ин», который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Скирдин, то есть сын Скирды. Это типичная схема для фамилий, возникших из прозвищ, а не из крестильных имён. В отличие от фамилий на «-ов» (Скирдов), вариант с «-ин» в данном случае логичнее: слово «скирда» женского рода, и суффикс «-ин» охотнее присоединялся к основам на -а.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским областям, особенно к Курской, Орловской, Воронежской губерниям, где скирдование было основным способом хранения сена в степной зоне. Встречается она и на Урале, куда переселенцы принесли свой говор и хозяйственный уклад. В переписных книгах XVII века можно найти крестьян с прозвищем Скирда, но сама фамилия Скирдин в документах фиксируется с XVIII столетия, когда прозвища стали окончательно закрепляться за потомками.

Редкий нюанс: в некоторых говорах слово «скирда» имело значение «куча» или «громада» в переносном смысле, поэтому прозвище могли дать не только крестьянину, но и просто рослому, грузному человеку. Однако в подавляющем большинстве случаев корень лежит именно в сельскохозяйственной сфере, и предки носителей фамилии были хлеборобами или батраками, работавшими на сенокосе. Дворянских родов с такой фамилией не отмечено — это фамилия крестьянская, однодворческая, реже купеческая.