Фамилия Скробунова образована от мужской основы Скробун по типичной русской модели с суффиксом -ов. Женская форма фамилии указывает на принадлежность к роду Скробуновых. В центре внимания — прозвище или некалендарное имя Скробун, которое и стало корнем фамилии.

Самая вероятная версия связывает основу Скробун с глаголом «скрести» или «скроботать» (в диалектах — «скрести, царапать, скоблить»). В таком случае Скробун — прозвище человека, который занимался скоблением, например, скребницей чистил лошадей, скоблил кожи или строгал дерево. Это могло быть и прозвище по характеру: скряга, прижимистый человек, который «скребет» каждую копейку. Слово «скробун» в некоторых говорах означало «скряга» или «скупой», что делает эту версию логичной и бытовой.

Вторая, менее распространённая гипотеза, — связь с тюркскими корнями, где «скроб» могло означать что-то острое или колющее, но она не имеет убедительных лингвистических подтверждений и опирается на случайное звуковое сходство. Правдоподобнее считать фамилию восточнославянской, поскольку суффикс -ун в прозвищах характерен именно для русского языка (ср. Болтун, Молчун, Говорун) и указывает на деятеля или носителя признака.

Географически фамилия Скробунова встречается в основном на юге России и в Поволжье, что подтверждает её диалектную природу. Среди носителей фамилии преобладали крестьяне и мещане — прозвище Скробун не относилось к дворянскому сословию. В документах XIX века встречаются записи о Скробуновых в Воронежской и Саратовской губерниях, где слово «скробун» бытовало как местное обозначение скряги или работящего, но мелочного человека.

Таким образом, Скробунова — фамилия, прямо описывающая предка через его характер или занятие. Она не несёт в себе ни географической привязки к поместью, ни церковного имени — только меткое прозвище, которое закрепилось в роду и дошло до наших дней.