Фамилия Скуратова напрямую связана с прозвищем Скурат, которое носил её родоначальник. В основе лежит нарицательное слово «скурат» (или его более распространённый вариант «шкурат»), означавшее «лоскут кожи». Этимологически оно восходит к слову «скура» — так в старину называли грубую, невыделанную шкуру. Получается, что прозвище было не случайным: так могли назвать человека либо за жёсткий, неуживчивый характер (намекая на грубость, «толстокожесть»), либо по роду занятий, если он имел дело с кожей и мехами.

Существует и вторая версия, менее распространённая. Согласно ей, в основе лежит не прозвище, а языческое личное имя Шкурат, которое имело то же значение — «лоскут кожи». В древности имена, образованные от названий предметов быта или частей тела, встречались нередко, и Шкурат вполне могло быть таким именем-оберегом.

Фамилия образована по стандартной для русских фамилий модели: к основе Скурат добавили суффикс -ов, а затем и окончание -а, указывающее на женский род. Таким образом, Скуратова — это буквально «дочь (или жена) Скурата». Потомки человека с таким прозвищем со временем закрепили его за собой как родовое имя.

Любопытно, что чередование согласных «с» и «ш» в начале слова не меняет сути: оба варианта — и Скурат, и Шкурат — бытовали в народной речи. Это же различие породило и однокоренные фамилии: Скуратов, Шкуратов, а также более редкие варианты вроде Скуратовский. Выбор написания с буквой «с» в фамилии Скуратова мог закрепиться в документах случайно, из-за особенностей произношения в конкретной местности или при записи переписчиками.