Фамилия Соболеева — женская форма фамилии Соболеев, и её разбор лучше начать не с корня, а с необычного суффикса. В русской фамильной модели типичны окончания -ов/-ев, -ин, -ский. Здесь же мы видим суффикс -еев, который встречается реже. Он указывает на происхождение от прозвища или имени, оканчивающегося на -ей: Соболей. То есть предка могли звать не просто «Соболь», а именно «Соболей» — возможно, так в говорах называли человека, связанного с соболями: охотника, торговца пушниной или того, кто носил соболью шапку.

Основа фамилии — «соболь». Пушной зверь был ценным товаром на Руси, и прозвище Соболь давали либо ловкому, удачливому промысловику, либо человеку, который выделялся дорогой одеждой. Но форма Соболей, от которой пошла Соболеева, могла возникнуть и как патроним: сын Соболя превращался в Соболеева, если отца звали Соболей. В некоторых северных и сибирских говорах слово «соболей» означало «соболиный», «относящийся к соболю», и прозвище закреплялось за человеком по его занятию.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где был развит пушной промысел: Урал, Сибирь, север Европейской России. Встречаются варианты написания через одно «о» — Соболева, но это уже другая, гораздо более распространённая фамилия от той же основы, но с другим суффиксом. Соболеева — более редкая, и её носители, скорее всего, происходят из конкретной местности, где закрепилось именно такое окончание.

В ономастической литературе (например, в работах Б. Унбегауна) отмечается, что фамилии на -еев образуются от имён и прозвищ на -ей, -ай, что подтверждает нашу версию. Социальный статус предков мог быть разным: от крестьян-охотников до служилых людей, получавших жалованье соболями. Но однозначно сказать, что все Соболеевы — потомки какого-то одного сословия, нельзя: фамилия могла возникнуть в разных семьях независимо.